Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PdgfaP20033 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms