Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pou4f1P17208 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Pou4f1P17208 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms