Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
P10404 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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P10404 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
P10404 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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