Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms