Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms