Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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