Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Smg9Q9DB90 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms