Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms