Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ccdc47Q9D024 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Ccdc47Q9D024 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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