Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Cxxc1Q9CWW7 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms