Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms