Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Nhlrc3Q8CCH2 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms