Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NischQ80TM9 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NischQ80TM9 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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