Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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