Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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