Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms