Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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