Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms