Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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