Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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VdrP48281 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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VdrP48281 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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