Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rpl28P41105 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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