Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprkP35822 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprkP35822 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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