Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
RxraP28700 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
RxraP28700 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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