Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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H2-M5A7VMS3 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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