Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CtcflA2APF3 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms