Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3550W4VSN7 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms