Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rprd1bQ9CSU0 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Rprd1bQ9CSU0 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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