Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Gtpbp4Q99ME9 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Gtpbp4Q99ME9 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms