Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Prpf39Q8K2Z2 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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