Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms