Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smarca2Q6DIC0 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smarca2Q6DIC0 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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