Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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