Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Znf48Q3US17 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Znf48Q3US17 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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