Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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