Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Pde6bP23440 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Pde6bP23440 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6bP23440 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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