Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
P10404 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
P10404 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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P10404 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
P10404 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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