Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gm21976J3QNN2 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms