Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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Gm28038F7BCN9 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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