Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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