Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms