Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt27Q9Z320 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms