Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cib2Q9Z309 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cib2Q9Z309 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms