Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms