Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd2Q9Z2E1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd2Q9Z2E1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms