Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn8Q9Z260 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms