Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Loxl3Q9Z175 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms