Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo1Q9Z132 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms