Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup160Q9Z0W3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms