Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lemd3Q9WU40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lemd3Q9WU40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms