Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma1Q9R1P4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms